Главные речные фарватеры провинции — русла рек Нэнцзян (Nengjiang), Сунхуацзян (Сунгари), Тумэньцзян (Туманган) и Ялуцзян (Амноккан). Судоходство ведется, как правило, с середины апреля до последней декады ноября. Общая протяженность речного фарватера в провинции — 1789 км, речные порты — Даань, Цзилинь и Фуюй, грузооборот — 1,4 млн тонн в год.